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新品上市 | RNase R,富集circRNA好帮手!

随着新冠疫情大流行,mRNA疫苗/药物逐渐走入大众的视野。mRNA疫苗/药物具有设计快速、成本低和易于规模化生产的优点,但由于mRNA本身易降解,目前主要通过加帽加尾的方式提高mRNA制剂的稳定性,并辅助mRNA的翻译。近年来,研究者们在多种生物中发现了一种新型RNA——环状RNA(circular RNA, circRNA),此类RNA呈共价闭合环状结构,不易被核酸外切酶降解,较mRNA更加稳定,且可以实现非帽依赖蛋白质翻译。因此circRNA的发现为开发新一代生产工艺更简单、稳定性更好和时效更长的RNA疫苗及药物提供可能。

 

图1 :RNA疫苗作用过程[1]

 

circRNA生产过程包括:模板制备、体外转录、DNA模板去除、环化和纯化。在RNA环化后需要用核糖核酸酶R (Ribonuclease R, RNase R)对未环化的RNA进行消化,达到富集circRNA的目的。当前主流使用的RNase R主要为进口品牌,存在价格高、货期久等问题,不适合用于大批量生产。世界杯买球网站拥有双向分子酶理性设计与定向进化平台和专门为GMP级别产品打造的分子酶生产基地,从硬件和软件上同时保证产品的品质。经过对蛋白质结构进行理性设计和基于超高通量单细胞分选技术的定向进化,世界杯买球网站研发团队成功开发出一款纯度高、消化活性强的RNase R产品,为新一代RNA疫苗/药物上市提供助力!

 

 

世界杯买球网站RNase R

 

世界杯买球网站RNase R(Cat#14606ES)是一种来源于大肠杆菌的Mg2+依赖性3'→5'核糖核酸外切酶,它能消化所有的线性RNA,不易消化circRNA、套索RNA或3’端突出末端少于7 个核苷酸的双链RNA分子,常用于去除线性RNA分子,实现富集circRNA和套索RNA等非线性RNA的目的。

 

 

产品特点

  • 蛋白纯度(SDS-PAGE)≥95%;

  • 无核酸外切酶残留;

  • 与A进口品牌RNase R产品消化线性RNA能力相当;

  • 与A进口品牌RNase R产品对circRNA富集作用相当。

 

 

性能展示

 

蛋白纯度(SDS-PAGE)≥95%

 

 

图2:蛋白纯度检测:使用SDS-PAGE技术检测产品的蛋白纯度,从左到右依次为相同产品浓度下不同体积(1 μL,2 μL,3 μL)的结果,结果表明世界杯买球网站RNase R(Cat#14606ES)产品蛋白纯度≥95%。

 

无核酸外切酶残留

 

图3:核酸外切酶残留检测:将20 U 世界杯买球网站RNase R加入到 0.5 μg λDNA- Hind Ⅲ digest中,于37℃孵育4小时,之后进行琼脂糖凝胶电泳 ,结果显示DNA 条带未发生变化,说明世界杯买球网站RNase R(Cat#14606ES)产品无核酸外切酶残留。

 

与A进口品牌RNase R产品消化线性RNA能力相当

 

图4:世界杯买球网站RNase R(Cat#14606ES)产品与A进口厂家RNase R产品消化线性RNA能力比较:将世界杯买球网站RNase R(Cat#14606ES)产品与A进口厂家RNase R产品分别投入含有线性RNA底物的反应体系中进行反应,结果显示当RNase R产品的投入量达到2-4 U时,可观察到RNA条带变微弱甚至消失,表明RNase R对线性RNA分子具有消化作用,且世界杯买球网站RNase R(Cat#14606ES)产品与A进口厂家RNase R产品对线性RNA分子的消化能力相当。

 

与A进口品牌RNase R产品对circRNA富集作用相当

 

图5:世界杯买球网站RNase R(Cat#14606ES)产品与A进口厂家RNase R产品对circRNA的富集作用比较:将世界杯买球网站(Cat#14606ES)产品与A进口厂家RNase R产品分别投入含有circRNA底物的反应体系中进行反应,结果显示经过世界杯买球网站RNase R(Cat#14606ES)产品与A进口厂家RNase R产品处理后的RNA条带亮度基本无差别,表明circRNA能耐受RNase R的消化。以上结果证实世界杯买球网站(Cat#14606ES)产品与A进口厂家RNase R产品均能有效用于circRNA富集。

 

 

客户反馈

 

世界杯买球网站RNase R对线性RNA的切割效果优于其他品牌

 

图6:世界杯买球网站(Cat#14606ES)产品与厂家A和B的RNase R消化线性mRNA分子效果比较:将世界杯买球网站RNase R(Cat#14606ES)产品与厂家A和B的RNase R产品分别投入含有1 μg 线性mRNA底物的反应体系中进行反应,结果显示世界杯买球网站RNase R(Cat#14606ES)产品对线性RNA的消化效果优于厂家A和B的RNase R。(数据来源于深圳**客户)

 

 

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参考文献

1. Qu L, Yi Z, Shen Y, et al. Circular RNA vaccines against SARS-CoV-2 and emerging variants. Cell. 2022;185(10):1728-1744.e16. doi:10.1016/j.cell.2022.03.044

2. Chen L, Wang C, Sun H, et al. The bioinformatics toolbox for circRNA discovery and analysis. Brief Bioinform. 2021;22(2):1706-1728. doi:10.1093/bib/bbaa001

 

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